ASPECTOS GERAIS SOBRE A MODELAGEM COMPARATIVA DE PROTEÍNAS

Resumo

A caracterização funcional de uma sequência proteica é um dos principais problemas da biologia. Esse problema é facilmente minimizado com o estudo da estrutura tridimensional da proteína em questão. Na ausência de uma estrutura determinada experimentalmente, a modelagem comparativa ou por homologia pode, na maioria das vezes, construir uma estrutura tridimensional. Contudo, a modelagem comparativa implica na existência de uma proteína-molde anteriormente determinada. Por construir a estrutura tridimensional de uma proteína baseado em um molde, a modelagem comparativa é considerada a técnica mais acurada na determinação de estruturas in silico. A modelagem comparativa envolve os seguintes passos: alinhamento e seleção da estrutura molde, construção do modelo, refinamento, modelagem das alças, modelagem das cadeias laterais e validação. Além das características funcionais, a modelagem comparativa pode fornecer subsídios para o estudo de inibidores proteicos a partir da estrutura gerada. Por fim, esta revisão focou o uso da modelagem comparativa e seus principais passos envolvidos na determinação de estruturas proteicas.